Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDCQ9Y266 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms