Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms