Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms