Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRQQ9UMZ3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRQQ9UMZ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRQQ9UMZ3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRQQ9UMZ3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRQQ9UMZ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRQQ9UMZ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRQQ9UMZ3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRQQ9UMZ3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRQQ9UMZ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRQQ9UMZ3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRQQ9UMZ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
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