Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPDR1Q9UM22 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms