Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP8AP2Q9UKL3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms