Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms