Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF639Q9UID6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF639Q9UID6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF639Q9UID6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF639Q9UID6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF639Q9UID6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF639Q9UID6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF639Q9UID6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF639Q9UID6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF639Q9UID6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF639Q9UID6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF639Q9UID6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF639Q9UID6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF639Q9UID6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF639Q9UID6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF639Q9UID6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF639Q9UID6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms