Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms