Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPC1L1Q9UHC9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms