Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms