Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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