Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms