Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNQ9P2M7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNQ9P2M7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms