Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP2BPQ9P2M1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms