Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC43.58■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC43.58■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC43.58■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.57■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC43.57■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC43.55■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC43.52■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CCDC180Q9P1Z9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC43.49■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms