Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms