Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms