Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPG21Q9NZD8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms