Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms