Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms