Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms