Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms