Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDND1Q9NY35 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms