Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms