Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM28Q9NW13 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms