Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms