Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms