Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms