Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKN1Q9NS71 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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