Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms