Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
DUOX2Q9NRD8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
DUOX2Q9NRD8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms