Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN4Q9NQC3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms