Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ASCL3Q9NQ33 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms