Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP13A2Q9NQ11 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP13A2Q9NQ11 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP13A2Q9NQ11 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP13A2Q9NQ11 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP13A2Q9NQ11 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP13A2Q9NQ11 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP13A2Q9NQ11 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP13A2Q9NQ11 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP13A2Q9NQ11 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP13A2Q9NQ11 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP13A2Q9NQ11 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP13A2Q9NQ11 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP13A2Q9NQ11 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP13A2Q9NQ11 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms