Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-5Q9HDB9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms