Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms