Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms