Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB90

RRAGC, Ras-related GTP-binding protein C, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGCQ9HB90 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGCQ9HB90 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGCQ9HB90 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms