Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms