Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms