Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms