Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms