Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms