Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms