Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms