Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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