Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRNKL1Q9BZJ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
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