Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms