Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
RNF17Q9BXT8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms